Ciudad de hueso sigue a Clary Fray, una adolescente neoyorquina que una noche presencia un asesinato imposible en una discoteca y descubre que existen demonios, brujos, vampiros y cazadores de sombras ocultos a la vista de los humanos. A partir de ese encuentro, su vida cotidiana se desarma cuando su madre desaparece y su propia identidad queda ligada a ese mundo secreto.

La novela mezcla fantasía urbana, aventura juvenil y conflicto de linajes. Su fuerza está en la entrada progresiva de Clary en un universo regido por pactos, peligros y jerarquías, mientras intenta entender qué papel le corresponde dentro de una guerra que ya estaba en marcha.